Interactions plante-microorganismes
Pôle ITEM : InTeractions – Evolution and Mechanisms
Missions du pôle
Le pôle ITEM s’intéresse au dialogue moléculaire et aux processus évolutifs qui façonnent l'interaction entre les plantes et les microorganismes symbiotiques ou pathogènes. Les questions majeures que nous nous posons sont :
- Quels sont les bases génétiques et les mécanismes de la virulence chez les pathogènes, et de la résistance et de la sensibilité aux maladies chez les plantes ?
- Quelles sont les bases génétiques et les mécanismes de la symbiose rhizobium- légumineuse?
- Comment évoluent les génomes et les déterminants moléculaires de la virulence, de l'immunité et de la sensibilité aux maladies dans les populations pathogènes et leurs hôtes ?
- Quels facteurs déterminent l’efficacité et la durabilité des résistances naturelles aux maladies dans les cultures ?
- Quels mécanismes moléculaires sont partagés entre interactions pathogènes et symbiotiques?
Nos systèmes d'études sont les principales maladies causées par des bactéries ainsi que la symbiose entre des légumineuses tropicales modèles (Aeschynomene) ou cultivées avec des bactéries du genre Bradyrhizobium.
sur les grandes cultures (riz, céréales, manioc, banane...) en milieu tempéré et tropical, que nous étudions à de multiples échelles : moléculaire et cellulaire pour les approches fonctionnelles ; au sein de la parcelle et du bassin de production, ou à un niveau régional, voire mondial pour les approches évolutives et épidémiologiques.
Notre travail vise à une meilleure compréhension des processus fondamentaux régissant les interactions plante-microorganismes et la production de connaissances opérationnelles favorisant 1) une résistance naturelle plus forte des cultures, 2) la mise en place de stratégies de déploiement de résistances mieux adaptées au pathogène, et 3) une meilleure traçabilité des épidémies et des risques d’émergences. L’amélioration de la fixation biologique de l’azote chez les légumineuses tropicales cultivées
Un de nos objectifs majeurs est de promouvoir une agriculture durable dans les pays en développement, en collaboration étroite avec de nombreuses institutions de recherche et de formation en Afrique, en Asie du Sud-Est et en Amérique du Sud.
Activités de transfert et expertise
- Suivi de la résistance aux fongicides dans les populations fongiques.
- Évaluation de nouveaux fongicides et d’agents de lutte biologique.
- Diagnostic des maladies et monitoring de populations: détection, typage d’isolats, épidémiosurveillance.
- Nouvelles sources de résistance par criblage de matériel génétique et approches biotechnologiques innovantes.
- Consulting pour programmes de sélection.
- Caractériser de nouvelles souches de Bradyrhizobium pour proposer des inoculants adaptés aux légumineuses tropicales cultivées.
Équipes de recherche
- BLAST - Génétique et génomique des populations fongiques
- CIME - Immunité chez les céréales et effecteurs du champignon pathogène Magnaporthe
- FBI - Maladies fongiques du bananier
- MSLT - Mécanismes Symbiotiques chez les Légumineuses Tropicales
- XPLAIN - Pathogénie et évolution de Xanthomonas - Recherche et développement