Equipe BLAST
Missions de l'équipe
Fournir des connaissances fondamentales sur la biologie, l'évolution et l'adaptation des agents pathogènes fongiques, connaissances indispensables pour détecter ces agents pathogènes, surveiller les épidémies, prévenir les émergences et les adaptations, et imaginer de nouvelles stratégies de lutte.
Objectifs généraux
Les objectifs généraux sont de comprendre comment les génomes et les déterminants moléculaires du pouvoir pathogène évoluent dans les populations de champignons pathogènes de plantes.
Pour cela nous caractérisons les forces et retraçons les histoires évolutives qui gouvernent l’adaptation des populations fongiques à leur hôte et à leur environnement, en étudiant particulièrement les sauts d’hôtes et les contournements des résistances des plantes. Nous caractérisons également les bases génomiques de ces adaptations en utilisant des approches innovantes et puissantes (scans génomiques, génomique d’association) pour identifier les gènes et locus clés impliqués dans les interactions entre les champignons phytopathogènes et leurs plantes. Nous utilisons l’évolution moléculaire pour comprendre comment ces loci évoluent et co-évoluent avec leurs cibles végétales dans les populations naturelles de champignons phytopathogènes analysées à différentes échelles de temps et d’espace (échantillons historiques, populations contemporaines). Enfin, nous étudions l’impact de la coévolution entre agent pathogène et hôte sur l’organisation des génomes des deux protagonistes.
Le modèle principal de l’équipe est le champignon ascomycète Pyricularia oyzae, agent de la pyriculariose sur le riz et d’autres céréales. Nous étudions aussi d’autres agents pathogènes fongiques causant des maladies sur le riz et l’orge (notamment les complexes d’espèces responsables des helminthosporioses sur ces deux plantes), et d’autres plantes.
Un autre sujet de l’équipe est l’étude des déterminants de l’immunité fongique et de leur évolution, afin de mieux comprendre comment les champignons résistent à leur propres pathogènes (par exemples les bactéries antagonistes et mycophages) pour imaginer de nouvelles méthodes de lutte biologique basées sur ce type d’interactions.
Thématique de recherche
La thématique générale est l’étude des mécanismes proximaux et ultimes et des processus qui pilotent l’adaptation des agents pathogènes à leur environnement biotique et abiotique, et la co-évolution entre les agents pathogènes et leurs hôtes.
Les disciplines centrales sont la biologie évolutive, la génomique évolutive et des populations, et l’évolution moléculaire.
Échelle d'étude
Populations à différentes échelles spatiales (champ / bassin de production / pays / continent / monde).