Equipe MOMIE
Question et thématiques de recherche
- Quel est l'impact des pratiques agricoles sur les interactions plantes-agents pathogènes?
- Peut-on prévoir la manière dont une plante va prioriser sa réponse immunitaire dans un agro-environnement donné ?
- Caractériser les mécanismes racinaires d’interaction plante-plante, du gène au champ
Figure 1 : L’équipe MOMIE s’intéresse à l’impact de certaines pratiques agricoles (mélanges variétaux, culture intercalaire, biostimulant racinaire, stimulateur de défense, choix variétal) sur la physiologie, l’immunité et la résistance aux maladies fongiques des céréales.
Objectifs généraux
Les plantes développent des réponses immunitaires fortes et rapides pour résister ou limiter l'infection par les agents pathogènes. Cependant, certains mécanismes de défense immunitaire fluctuent voire s’affaiblissent dans certaines conditions de terrain (fertilisation azotée, sécheresse). Les défenses immunitaires peuvent aussi être renforcées dans certains contextes, en particuliers lorsque certains génotypes de plantes sont co-cultivés avec d’autres plantes de la même espèce, voire même d’une autre espèce. Nos objectifs de recherche sont donc centrés sur les mécanismes de l'immunité des céréales dans des contextes environnementaux et écologiques perturbateurs, et visent à caractériser les mécanismes impliqués dans les interactions plante-plante pour fournir de nouvelles solutions basées sur la nature.
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Figure 2 : Parmi les différents facteurs environnementaux, nous nous intéressons particulièrement à l’impact de la présence des plantes voisines sur l’immunité des céréales. Nous cherchons à caractériser les principales étapes d’une interaction plante plante. 1 l’identification des signaux, 2 la perception par la plante de la présence d’une voisine, 3 les modifications moléculaires au sein de la plante et 4 les changements anatomiques, développementaux qui peuvent se traduire par une résistance ou une sensibilité modifiée. 5 Ces interactions plante-plante impliquent des processus écologiques liés à la compétition ou à la facilitation et sont la traduction de 0 phénomènes évolutifs que nous étudions avec nos partenaires.
Figure 3 : Un deuxième modèle de l’équipe est l’utilisation des produits de biocontrôle et/ou de biostimulation et leur impact sur la physiologie des céréales. Nous cherchons notamment à comprendre les compromis que les plantes mettent en place entre des stratégies privilégiant leur croissance et des stratégies privilégiant leur résistance aux maladies.
Modèles d’étude
Nos modèles d’études sont des céréales (blé, riz, orge) et les principales maladies fongiques aériennes. Nos concepts sont régulièrement mis à l’épreuve du terrain dans le cadre du suivi de micro-parcelles en mélange ou sous conduite bas intrants.
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Nos innovations techniques
Nous participons à la mise au point de nouveaux outils de phénotypage pour faciliter la caractérisation de nos modèles d’étude.
- pour la quantification des symptômes par deep learning: Outils SeptoSympto
- pour l’évaluation par NIRS de la réponse physiologique du blé lors de son interaction avec la septoriose
- pour la caractérisation moléculaire de la réponse du riz, du blé et du pois à des produits de biocontrôle ou de biostimulation
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.12.14.520374v
Nos financements
Nos principaux projets de recherche actuellement sont le projet StimCross financé par la BPI (Banque Publique d’Investissement France Relance 2030) et le projet Mobidiv financé par l’ANR- CPA (Programme Prioritaire de Recherche “Cultiver Protéger Autrement”).
Nos recherches se font en interaction avec les entreprises et les instituts techniques. Ainsi nous participons et animons le Réseau Mixte et Technologique Bestim et la chaire d’entreprise Agrosys.
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Nous contribuons au projet de Laboratoire International Associé “Plantomix”, avec la Yunnan Agricultural University (Kunming, Yunnan; Chine) dont l’objet d’étude sont des rizières dans lesquelles est observée une durabilité de la résistance ( projet “Riz Eternél”, voir vidéos ).
Publications
