La compréhension de la dynamique de la biodiversité est un enjeu majeur des recherches sur le monde vivant, et les interactions entre les hôtes et leurs agents pathogènes en sont un moteur important. En postdoctorat, sur un champignon pathogène du plantain lancéolé, puis sur les maladies du riz au Burkina Faso depuis mon recrutement à l’IRD, je développe des approches intégratives visant à comprendre la dynamique de la biodiversité microbienne associée aux plantes. Les questions abordées sont les suivantes : Quels facteurs structurent la diversité à l’échelle des communautés microbiennes, ou en intra-spécifique, en termes de diversité génétique et pathogénique ? Quel est l’impact des infections multiples (=co-infection d’une même plante par plusieurs espèces, ou plusieurs génotypes, d’agents pathogènes) ? Ou encore, comment évoluent les populations d’agents pathogènes et quelles sont les conséquences sur les épidémies ? Je présenterai les résultats obtenus sur ces thématiques, ainsi que mon projet de recherche, portant sur la dynamique de virus associés aux plantes dans le contexte actuel de changements globaux.

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