Missions de l'équipe

• Nos travaux visent à améliorer la Fixation Biologique de l’Azote (FBA) chez les légumineuses tropicales cultivées. Pour cela nous étudions comment ces plantes interagissent avec les bactéries symbiotiques et les autres microbes de la rhizosphère et nous analysons l’impact de ces interactions sur la santé nutritionnelle de la plante. • Nous travaillons à l’échelle du laboratoire, mais aussi au champ (station expérimentale et champs paysan) afin d’appréhender l’impact de l’environnement et des pratiques agricoles sur la FBA. • Nous développons nos recherches en étroite collaboration avec des partenaires d’autres instituts français et des pays du Sud et nous intervenons pour former des étudiants et chercheurs Nord et Sud à nos thématiques (licence, master, thèse, post-doc).

Objectifs généraux

• Identifier des locus à caractère quantitatif (QTL) liés à la fixation d’azote de l’arachide en zone Sahélienne.Nos analyses exploitent la diversité naturelle du genre Arachis (espèces sauvages) mais aussi la diversité sélectionnée parles producteurs africains (core collection de variétés africaines).
• Caractériser et isoler le fertibiome de l’arachide au Sénégal en en Argentine (zone d’origine de l’arachide); comprendre les bases génétiques qui déterminent le recrutement et l’effet des micro-organismes bénéfiques associés à l’arachide.
• Identifier les gènes correspondant aux QTLs majeurs contrôlant la fixation d’azote et caractériser leur mode d’action au laboratoire et au champ, en particulier leu reffet sur le fertibiome (recrutement de Bradyrhizobium efficaces, PGPR et champignons mycorhiziens).

• Utiliser les connaissances et les outils disponibles pour les légumineuses modèles (tempérées et tropicales) et les autres plantes fixatrices d’azote pour étudier les mécanismes symbiotiques de l’arachide par des approches de génétique inverse. Examiner en particulier le rôle de gènes symbiotiques fortement exprimés à fonction inconnue comme les subtilases.
• Développer des outils pour répondre aux différents objectifs scientifiques : évaluation de la FBA au champ, transformation génétique stable, biosenseurs symbiotiques (GECO),génomique comparative (phylogénomique, transcriptomique), analyse du microbiome(métabarcoding), interactions protéiques (interactome et degradome).

Thématique/discipline de recherche

• Agriculture sobre.
• Agroécologie.
• Santé nutritionnelle des plantes
•  Interactions plante-microorganismes bénéfiques.
• Fixation biologique de l’azote.
• Génomique fonctionnelle.
• Physiologie moléculaire.
• Microbiologie.
• Génétique quantitative.
• Biologie cellulaire. Biochimie.

Echelle d'étude

Des molécules, gènes et génomes à la plante au champ ; holobionte.

L'équipe